2009年12月21日 星期一

討厭的泡泡

這篇重新回來談到實驗相關的東西,而這次想跟大家聊聊泡泡這個東西!!一定會有人覺得奇怪~這有啥好講的,但我認為不管在做任何基礎實驗時都一定會要跟這個討厭的東西來做抗戰阿,以下就舉出我在實驗室時的種種經驗和解決方法囉。

首先大家都一定知道泡泡最主要的原因就是兩個物質中間有氣體進入其中而產生了空隙,而最常發生的就是用pipet吸取東西時所產生的,而如果在吸取過程中有泡泡進入tip內其對於吸取的量就會產生很大的影響,避免的方式當然就是務必確保你的tip尖端有確實深入sample下,而還有一種情況是你會發現有時候會有東西卡在tip內load不下去,這時候通常是代表說你的tip與pipet間的空隙過大(白話一點就是沒插緊啦),這時候有一種解決方式是你用手夾住tip的上端,然後把他吐掉重新裝回去即可重新再load。

第二種會出現泡泡的情況就是我們常在做的做膠,一般來說煮膠的方式就是buffer加上agarose後搖一搖丟進微波爐煮到沸騰就搞定了,但這通常是只用到煮1%左右的gel會沒有問題,如果是%數較高的gel,沒有按照一定的方式煮的話保證你泡泡多到你笑不出來,至於該怎麼做我們現在就來談談吧,先不談幾%的gel,通常你去煮膠一定會產生泡泡,但如果是為數較少的要怎麼解決呢,很簡單,煮完後先把火燙的膠瓶的蓋子轉緊,然後拿去沖冷水,等到稍稍降溫後旋開蓋子後會聽到嘶~~的一聲就幾乎是成功了,因為這時候裡面的泡泡會隨之破掉,而倒膠時如還有殘留的小泡可用tip挑到旁邊,只要不影響跑膠的區域即可,而在面對%數較高的gel,差別只在於煮膠的方式,此時應把加熱強度轉小,用小火慢煮長時間,泡泡會少很多喔,但要另外注意的是煮膠時間拉長時液體容易揮發掉,所以可再煮之間在膠瓶上面做記號,等出來時如看到有減少的話再補充ddwater即可。而acrylamide gel的部分我想就留到之後講western的部分時再來說吧。

第三種情況是再做細菌的plate時,我們常說的倒盤,此時如果有產生氣泡的話,要記得用噴火槍把泡泡燒破,要不然agar的表面會不平,實驗結果也不好看喔,而噴火槍一般在十元商店就買得到了,便宜好用,比酒精燈好太多了。

最後來談談其他種情況吧,平常最容易產生泡泡的buffer當然就是有加入detergent的那種,像是tween20或是triton x-100,加進去後搖晃都會有大量的泡泡,但通常只要經過滅菌的手續後就會破掉啦,而其他要注意的是像是PCR時我們在mix原料時切記不要有泡泡的產生,要不然有可能會影響到反應的效果喔。照膠時也要特別去注意是否有泡泡在背後,如果有泡泡的話會產生反光影響對比,可以把gel重新拿起再重放一次即可解決。而做transfer時也要記得把泡泡壓出以免影響protein無法順利轉到membrane上喔。

目前想到的大概就是這些吧,遺漏的部分可能之後在其他單元會出現或者會直接修改此篇,謝謝各位的觀看

by 深深覺得冬天真是個睡覺的好季節的Vanness

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